切换至 "中华医学电子期刊资源库"

中华妇幼临床医学杂志(电子版) ›› 2016, Vol. 12 ›› Issue (06) : 720 -725. doi: 10.3877/cma.j.issn.1673-5250.2016.06.019

所属专题: 文献

论著

广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
郭梦杰1, 胡兢晶1, 王波1,(), 苏海浩1, 伍苑宾1, 蔡丽君1, 谭琪琪1   
  1. 1. 511442广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科
  • 收稿日期:2016-04-05 修回日期:2016-10-15 出版日期:2016-12-01
  • 通信作者: 王波

Sequence analysis of UL142 gene of human cytomegalovirus virus strain in Guangzhou

Mengjie Guo1, Jingjing Hu1, Bo Wang1,(), Haihao Su1, Yuanbin Wu1, Lijun Cai1, Qiqi Tan1   

  1. 1. Department of Pediatrics, Guangdong Maternal and Child Health Hospital, Guangzhou 511442, Guangdong Province, China
  • Received:2016-04-05 Revised:2016-10-15 Published:2016-12-01
  • Corresponding author: Bo Wang
  • About author:
    Corresponding author: Wang Bo, Email:
引用本文:

郭梦杰, 胡兢晶, 王波, 苏海浩, 伍苑宾, 蔡丽君, 谭琪琪. 广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析[J/OL]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2016, 12(06): 720-725.

Mengjie Guo, Jingjing Hu, Bo Wang, Haihao Su, Yuanbin Wu, Lijun Cai, Qiqi Tan. Sequence analysis of UL142 gene of human cytomegalovirus virus strain in Guangzhou[J/OL]. Chinese Journal of Obstetrics & Gynecology and Pediatrics(Electronic Edition), 2016, 12(06): 720-725.

目的

探讨广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL142基因的序列特征。

方法

选取2014年3月至2015年12月在广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科就诊的10例HCMV症状性感染患儿的尿液标本为研究对象。将从HCMV症状性感染患儿尿液标本中分离出的病毒株进行多重PCR鉴定,对UL142基因全序列克隆到pMD18-T载体上扩增并将产物进行测序,将测序结果提交GenBank并与GenBank收录的其他10株HCMV病毒株的UL142基因进行比对分析。

结果

从广州地区HCMV症状性感染患儿尿液中成功分离2株HCMV临床病毒株,分别命名为HCMV D2和D3;克隆测序后由GenBank收录,收录号分别为DQ180384和DQ180370。各HCMV病毒株的UL142基因同源性比对分析发现:UL142基因序列较保守,有69处碱基发生变异,且均为点突变,无插入及缺失突变;编码蛋白的氨基酸残基为306个,序列也较保守,其中28处点突变导致编码氨基酸的改变,其余点突变均未导致编码氨基酸改变。不同HCMV病毒株中UL142基因所编码的氨基酸变异率为0.9%~6.5%。各HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的二级结构的氨基酸数目不同,但所有HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的等电点均在6.48~8.27。

结论

广州地区HCMV临床低传代病毒株ULl42基因序列及其编码产物的氨基酸序列均较为保守,但仍存在一定的多态性,这提示UL142基因在HCMV感染与致病机制的研究中可能具有重要作用。

Objective

To detect UL142 gene sequence characteristics of the clinical low passage human cytomegalovirus (HCMV) isolates in Guangzhou.

Methods

From March 2014 to December 2015 at the Guangzhou Medical University Affiliated pediatric clinic of Guangdong women and children's Hospital of 10 cases of symptomatic HCMV infection in children with urine samples as the research object. Identify virus strains isolated from urine samples of children with symptomatic HCMV infection using multiple polymerase chain reaction (PCR), and the whole sequence of UL142 gene was cloned into pMD18-T vector and amplified, the sequencing results were submitted to GenBank, and UL142 gene of the other 10 HCMV isolates in the GenBank were compared and analyzed together.

Results

Two HCMV clinical isolates were successfully isolated from the urine sample of children with symptomatic HCMV infection in Guangzhou, named for HCMV D3 and D2. The GenBank included them after cloning and sequencing, and the included sequences were DQ180370 and DQ180384. Homology comparison analysis showed UL142 gene sequences were more conservative, there were 69 base mutations, and all these 69 base mutations were base substitutions, and no insertion and deletion mutations. There were 306 amino acid residues in the protein coding, sequence and more conservative, of which 28 nucleotide point mutation resulted in the change of amino acids and bases for the rest of the mutation did not cause amino acid changes, different isolates variation rate for 0.9%-6.5%. The number of amino acids in the two stage structure of each isolate was different but the isoelectric points of all the isolated strains were in 6.48-8.27.

Conclusions

UL142 gene sequence and amino acid sequence of the HCMV clinical isolates in Guangzhou are more conservative, but there are still some polymorphism, it suggests that the UL142 gene may play an important role in the progress of HCMV infection and pathogenesis.

图3 人巨细胞病毒D2、D3 UL142基因PCR鉴定电泳图(1~3:人巨细胞病毒D2 UL142基因重组质粒PCR鉴定; 4~6:人巨细胞病毒D3 UL142基因重组质粒PCR鉴定)
表1 人巨细胞病毒UL142基因序列及其编码氨基酸序列的比较
基因碱基位点(比对病毒株) 碱基改变 氨基酸残基位点 编码氨基酸的改变
23(39J、1M、12M、20M) G→T 8 Trp→ Leu
25(39J、1M、12M) T→C
96(25J、39J、1M、12M、20M) T→C
106(25J、39J、1M、12M、20M) A→G
108(25J、39J、1M、12M、20M) C→T 36 Asn→ Asp
111(25J、39J、1M、12M、20M) G→A
112(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) A→G 38 Ile→Val
117(25J、39J、1M、12M、20M) T→G
153(25J、39J、1M、12M、20M) A→G
162(25J、39J、1M、12M、20M) A→G
177(25J、39J、1M) A→G
228(29C、2J、25J、39J、1M、14M、20M) G→A
241(25J、39J、1M、20M) T→C 81 Ser→ Pro
244(25J、39J、1M、20M) T→A 82 Trp→ Arg
258(25J、39J、1M、20M) G→A
266(25J、39J、1M、20M) G→A 89 Ser→Asn
280(25J、39J、1M、20M) A→G
283(25J、39J、1M、20M) A→G 94 Ser→Gly
284(25J、39J、1M、20M) C→A 95 Thr→Asp
288(25J、39J、1M、20M) C→T
322(12M) C→T 108 His→ Tyr
339(D3) T→C
347(2J) C→G 116 Thr→Arg
351(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) G→A
360(D3) A→G
364(29C、2J、25J、14M、20M) T→C
372(D3、29C、2J、14M) G→A
390(29C、2J、14M) T→C
421(29C、2J、14M) A→G 141 Ile→ Ala
422(29C、2J、14M) T→C
428(25J) T→C 143 Val→ Ala
429(29C、2J、12M、14M、20M) G→A
433(29C、2J、12M) G→A
444(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) T→C
455(29C、2J、12M、14M、20M) T→C 152 Ile→ Thr
478(1M) C→T
486(29C、2J、12M、14M、20M) C→T
基因碱基位点(比对病毒株) 碱基改变 氨基酸残基位点 编码氨基酸的改变
491(29C、2J、12M、20M) T→C 164 Val→Ala
501(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) C→T
520(D3) G→A 174 Glu→ Lys
525(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) A→G
540(20M) T→C
543(29C、2J、12M、14M、20M) A→C 181 Gln→His
601(25J、39J) T→A 201 Tyr→Asn
607(29C、2J、1M、12M) A→G 203 Ile→ Ala
608(14M、25J、39J、20M) T→C 203 Ile→ Thr
615(29C、2J、1M、12M、14M、20M) A→G
647(29C、2J、1M、12M、14M、20M) T→C 216 Ile→ Thr
651(29C、2J、1M、12M、14M、20M) A→C
673(29C、2J、1M、12M、14M、20M) A→G 225 Asn→ Asp
676(29C、2J、1M、12M、14M、20M) A→G 226 Thr→Ala
687(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) C→T
717(20M) G→A
718(29C、2J、1M、12M、14M、20M) A→G 240 Thr→Ala
723(14M) G→A
729(D3、29C、2J、1M、12M、14M、20M) C→T
733(25J、39J) G→A 245 Asp→Asn
735(14M) C→T
740(D3、29C、2J、25J、39J、1M、12M、14M、20M) G→A 247 Arg→ His
759(29C、2J、1M、12M、14M、20M) A→G
792(14M) G→A
819(25J、39J) C→T
843(25J、39J) C→T
856(25J、39J) A→G 286 Ser→Gly
870(D3、25J、39J) A→G
903(D3、14M、25J、39J) A→G
904(12M) G→T 302 Val→Leu
911(20M) G→A 304 Arg→ His
918(14M) G→A
表2 人巨细胞病毒不同临床病毒株UL142基因编码蛋白中参与形成的理论二级结构的氨基酸数目
[1]
NaingZW,ScottGM,ShandA,et al. Congenital cytomegalovirus infection in pregnancy: a review of prevalence, clinical features, diagnosis and prevention[J]. Aust N Z J Obstet Gynaecol, 2016, 56(1): 9-18.
[2]
ZhangX, FanJ, YangMF, et al. Monitoring of human cytomegalovirus infection in bone marrow and liver transplant recipients by antigenaemia assay and enzyme-linked immunosorbent assay[J]. J Int Med Res, 2009, 37(1): 31-36.
[3]
RevelloMG, GernaG. Human cytomegalovirus tropism for endothelial/ epithelial cells: scientific background and clinical implications[J]. Rev Med Virol, 2010, 20(3): 136-155.
[4]
ChaTA, TomE, KembleGW, et al. Human cytomegalovirus clinical isolates carry at least 19 genes not found in laboratory strains[J]. J Vir, 1996, 70(1): 78-83.
[5]
JinJ, HuC,WangP, et al. Latent infection of human cytomegalovirus is associated with the development of gastric cancer[J]. Oncol Lett, 2014, 8(2): 898-904.
[6]
刘畅,齐莹.人巨细胞病毒UL/b′'区基因编码蛋白生物学功能的研究进展[J].国际儿科学杂志,2012,39(6):591-595.
[7]
TomasecP, WangEC, DavisonAJ, et al. Down regulation of natural killer cell-activating ligand CD155by human cytomegalovirus UL141[J]. Nat Immunol, 2005, 6(2): 181-188.
[8]
HeoJ, PetheramS, DemmlerG, et al. Polymorphisms within human cytomegalovirus chemokine (UL146/UL147) and cytokine receptor genes (UL144) are not predictive of sequelae in congenitally infected children[J]. Virology, 2008, 378(1): 86-96.
[9]
王波,李月琴,叶宁,等.临床低传代人巨细胞病毒株UL148开放阅读框mRNA的表达与鉴定[J].中华医学杂志,2008,88(24):1693-1696.
[10]
WillsMR, AshiruO, ReevesMB, et al.Human cytomegalovirus encodes an MHC class Ⅰ-like molecule (UL142) that functions to inhibit NK cell lysis[J]. J Immunol, 2005, 175(11): 7457-7465.
[11]
AshiruO, BennettNJ, BoyleLH, et al. NKG2D ligand MICA is retained in the cis-Golgi apparatus by human cytomegalovirus protein UL142[J]. J Virol, 2009, 83(23): 12345-12354.
[1] 周璐, 徐静, 徐琰. 循环肿瘤DNA检测在乳腺癌中的临床应用[J/OL]. 中华乳腺病杂志(电子版), 2022, 16(01): 47-50.
[2] 陈松, 黄玲巧, 余清卿, 魏志鑫, 付琰. 单细胞RNA测序技术在骨关节炎软骨中的研究应用[J/OL]. 中华关节外科杂志(电子版), 2024, 18(03): 363-371.
[3] 李志文, 康焱, 张紫机, 盛璞义, 廖威明, 毛谷平. 髋关节滑膜细胞组成及代谢差异生物信息学分析[J/OL]. 中华关节外科杂志(电子版), 2021, 15(03): 294-301.
[4] 何霞, 黄蓉, 祁文瑾. 胎膜早破孕妇胎盘与胎膜菌群丰度的高通量测序研究[J/OL]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2024, 20(05): 549-555.
[5] 李东明, 何升. 先天性巨细胞病毒感染早期筛查研究现状[J/OL]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2022, 18(06): 627-633.
[6] 廖雄宇, 邱坤银, 黄科, 黎阳, 徐宏贵, 方建培, 周敦华. 支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序对儿童肺部感染的病原体诊断价值[J/OL]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2022, 18(05): 562-568.
[7] 王大燕, 李小兵, 赖盼建. citrin缺陷所致新生儿肝内胆汁淤积症的SLC25A13基因IVS16ins3kb突变类型分析[J/OL]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2022, 18(03): 315-322.
[8] 林瀚妮, 李管明, 张霭润, 李宁宁, 房晓祎. ABCB4基因突变合并巨细胞病毒感染致婴儿胆汁淤积症的诊治分析并文献复习[J/OL]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2021, 17(01): 46-53.
[9] 陈艳, 侍效春, 刘晓清. 巨细胞病毒免疫逃逸机制研究进展[J/OL]. 中华实验和临床感染病杂志(电子版), 2023, 17(02): 73-78.
[10] 周莹莹, 邓莉平, 鲁植艳, 苏志颖, 熊勇. 获得性免疫缺陷综合征合并神经梅毒及巨细胞病毒脑炎一例并相关文献分析[J/OL]. 中华实验和临床感染病杂志(电子版), 2021, 15(05): 350-355.
[11] 李丹, 孙挥宇, 毛菲菲, 王胜男, 鲁丹, 刘夕瑶, 柳月红, 许雪静, 刘彬彬, 董愉. 获得性免疫缺陷综合征合并巨细胞病毒视网膜炎患者发生免疫恢复性葡萄膜炎的临床研究[J/OL]. 中华实验和临床感染病杂志(电子版), 2021, 15(03): 202-208.
[12] 巨春蓉, 门同义, 薛武军. 实体器官移植后难治性/耐药性巨细胞病毒感染诊疗进展[J/OL]. 中华移植杂志(电子版), 2024, 18(02): 86-92.
[13] 田敏, 王博, 刘学民, 张晓刚, 郭坤, 李宇, 胡良硕, 霍锦霞, 吕毅. 他克莫司个体内高变异度与肝移植术后免疫介导移植物损伤的临床研究[J/OL]. 中华移植杂志(电子版), 2022, 16(02): 65-71.
[14] 巨春蓉, 练巧燕, 蔡宇航, 陈奥, 徐鑫, 韦兵, 黄丹霞, 陈荣昌, 何建行. 胸腔脏器移植受者巨细胞病毒感染情况及预后分析[J/OL]. 中华移植杂志(电子版), 2021, 15(04): 193-198.
[15] 黄慧, 王卫云, 成晨, 刘娅, 陈欣林. Meckel-Gruber综合征的产前诊断学特征及文献复习[J/OL]. 中华诊断学电子杂志, 2022, 10(02): 77-82.
阅读次数
全文


摘要